यमुनोत्री मंदिर गढ़वाल हिमालय के पश्चिमी क्षेत्र में उत्तरकाशी जिले, उत्तराखंड में 3,291 मीटर (10,797 फीट) की ऊंचाई पर स्थित है। यह मुख्य जिला मुख्यालय उत्तरकाशी से सिर्फ 129 किमी दूर है. मंदिर देवी यमुना को समर्पित है और इसमें देवी की काले संगमरमर की मूर्ति है। यमुनोत्री मंदिर उत्तराखंड के मुख्य शहरों - उत्तरकाशी, ऋषिकेश, हरिद्वार या देहरादून से पूरे दिन की यात्रा है। वास्तविक मंदिर केवल हनुमान चट्टी शहर से 13 किलोमीटर (8.1 मील) ट्रेक और जानकी चट्टी से 6 किलोमीटर (3.7 मील) की पैदल दूरी पर पहुंचा जा सकता है; घोड़े या पालकी किराए पर उपलब्ध हैं। हनुमान चट्टी से यमुनोत्री तक की चढ़ाई कई झरनों को देखती है। हनुमान चट्टी से यमुनोत्री तक दो ट्रेकिंग मार्ग हैं, एक दाहिने किनारे के साथ मार्कंडेय तीर्थ के माध्यम से आगे बढ़ता है, जहां ऋषि मार्कंडेय ने मार्कंडेय पुराण लिखा था, दूसरा मार्ग जो नदी के बाएं किनारे पर स्थित है

खरसाली से होकर जाता है, जहां से यमुनोत्री पांच या छह घंटे की चढ़ाई दूर है।
यमुनोत्री मंदिर में देवी को समर्पित एक मंदिर है। गंगोत्री में 18वीं सदी का एक मंदिर भी है, इसे गढ़वाल नरेश प्रताप शाह ने बनवाया था, 19वीं सदी में इसे क्षतिग्रस्त कर फिर से नवीकृत किया गया था। पुनर्निर्माण से पहले मंदिर दो बार बर्फ और बाढ़ से नष्ट हो चुका है। यह बंदरपंच की पृष्ठभूमि पर स्थित है।  मंदिर श्रद्धेय चार धाम तीर्थ यात्रा सर्किट का हिस्सा है।
मंदिर अक्षय तृतीया (मई)  को खुलता है और सर्दियों के लिए यम द्वितीया (दिवाली के बाद दूसरे दिन, नवंबर) को बंद हो जाता है। थोड़ा आगे यमुना नदी का वास्तविक स्रोत है जो लगभग 4,421 मीटर (14,505 फीट) की ऊंचाई पर है। यमुनोत्री में दो गर्म झरने भी मौजूद हैं, जो 3,292 मीटर (10,801 फीट) की ऊंचाई पर थके हुए यात्रियों को राहत प्रदान करते हैं, सूर्य कुंड में गर्म पानी होता है, जबकि गौरी कुंड में नहाने के लिए उपयुक्त गुनगुना पानी होता है  झरने का पानी कहा जाता है। चावल और आलू पकाने के लिए पर्याप्त गर्म होने के लिए। मंदिर में आवास कुछ छोटे आश्रमों और गेस्ट हाउसों तक ही सीमित है।

 अभ्यास के अनूठे पहलुओं में गर्म झरने शामिल हैं जहां कच्चे चावल को पकाया जाता है और प्रसाद बनाया जाता है।
नोत्री चार धाम (गंगोत्री, केदारनाथ और बद्रीनाथ के साथ) का एक हिस्सा है, जो हिमालय में चार सबसे प्रतिष्ठित हिंदू तीर्थस्थल हैं। इसके केंद्र में यमुनोत्री मंदिर के साथ छोटा पहाड़ी गांव, हर साल हजारों भक्तों को आकर्षित करता है और चार धाम यात्रा तीर्थ यात्रा (मई से अक्टूबर) का प्रारंभ बिंदु है, जो यमुनोत्री से गंगोत्री और अंत में केदारनाथ और बद्रीनाथ तक जाता है। यमुना के स्रोत के करीब एक संकरी घाटी में स्थित, यमुनोत्री मंदिर गंगा के बाद दूसरी सबसे पवित्र नदी यमुना को समर्पित है। कहा जाता है कि यमुना नदी में डुबकी लगाने से अकाल मृत्यु से रक्षा होती है। जानकी चट्टी से मंदिर तक पहुंचने के लिए भक्त या तो पालकी या टट्टू की सवारी करते हैं या सवारी करते हैं (समुद्र तल से लगभग 3,233 मीटर), लगभग 3 किमी की लंबी पैदल यात्रा जिसमें लगभग 3 घंटे लगते हैं।

अनेक पुराणों में यमुना तट पर हुए यज्ञों का तथा कूर्मपुराण(39/9_13)में यमुनोत्तरी माहात्म्य का वर्णन है।केदारखण्ड(9/1-10)में यमुना के अवतरण का विशेष उल्लेख है।इसे सूर्यपुत्री,यम सहोदरा और गंगा- यमुना को वैमातृक बहने कहा गया है।ब्रह्मांड पुराण में यमुनोत्तरी को"यमुना प्रभव"तीर्थ कहा गया है।ॠग्वेद (7/8/19)मे यमुना का उल्लेख है।महाभारत के अनुसार जब पाण्डव उत्तराखंड की तीर्थयात्रा में आए तो वे पहले यमुनोत्तरी,तब गंगोत्री फिर केदारनाथ-बद्रीनाथजी की ओर बढ़े थे,तभी से उत्तराखंड की यात्रा वामावर्त की जाती है।हेमचन्द्र ने अपने "काव्यानुशान "मे कालिन्द्रे पर्वत का उल्लेख किया है,जिसे कालिन्दिनी(यमुना) के स्रोत प्रदेश की श्रेणी माना जाता है।डबराल का मत है कि कुलिन्द जन की भूमि संभवतः कालिन्दिनी के स्रोत प्रदेश में थी।अतः आज का यमुना पार्वत्य उपत्यका का क्षेत्र, जो रंवाई,जौनपुर जौनसार नामों से जाना जाता है,प्राचीनकाल में कुणिन्द जनपद था।"महामयूरी"ग्रंथ के अनुसार यमुना के स्रोत प्रदेश में दुर्योधन यक्ष का अधिकार था।उसका प्रमाण यह है कि पार्वत्य यमुना उपत्यका की पंचगायीं और गीठ पट्टी में अभी भी दुर्योधन की पूजा होती है।यमुना तट पर शक और यवन बस्तियों के बसने का भी उल्लेख है।काव्यमीमांसाकार ने 10वीं शताब्दी में लिखा है कि यमुना के उत्तरी अंचलों में जहाँ शक रहते हैं,

वहाँ यम तुषार- कीर भी है।इस प्रकार यमुनोत्तरी धार्मिक और ऐतिहासिक दोनों दृष्टिकोण से महत्वपूर्ण रही।(तप्तकुण्ड व अन्य कुण्ड) यमुनोत्तरी पहुँचने पर यहाँ के मुख्य आकर्षण यहाँ के तप्तकुण्ड हैं।इनमें सबसे तप्त जलकुण्ड का स्रोत मन्दिर से लगभग 20फीट की दूरी पर है,केदारखण्ड वर्णित ब्रह्मकुण्ड अब इसका नाम सूर्यकुण्ड एवं तापक्रम लगभग195डिग्री फारनहाइट है,जो कि गढ़वाल के सभी तप्तकुण्ड में सबसे अधिक गरम है।इससे एक विशेष ध्वनि निकलती है,जिसे "ओम् ध्वनि"कहा जाता है।इस स्रोत में थोड़ा गहरा स्थान है।जिसमें आलू व चावल पोटली में डालने पर पक जाते हैं,हिमाचल प्रदेश के कुल्लू जिले की पार्वती घाटी में मणिकर्ण तीर्थ में स्थित ऐसे ही तप्तकुण्ड को "स्टीम कुकिंग"कहा जाता है।सूर्यकुण्ड के निकट दिव्यशिला है।जहाँ उष्ण जल नाली की सी ढलान लेकर निचले गौरीकुण्ड में जाता है,इस कुण्ड का निर्माण जमुनाबाई ने करवाया था,इसलिए इसे जमुनाबाई कुण्ड भी कहते है।इसे काफी लम्बा चौड़ा बनाया गया है,ताकि सूर्यकुण्ड का तप्तजल इसमें प्रसार पाकर कुछ ठण्डा हो जाय और यात्री स्नान कर सकें। गौरीकुण्ड के नीचे भी तप्तकुण्ड है।यमुनोत्तरी से 4मील ऊपर एक दुर्गम पहाड़ी पर सप्तर्षि कुण्ड की स्थिति बताई जाती है।विश्वास किया जाता है कि इस कुण्ड के किनारे सप्तॠषियों ने तप किया था।दुर्गम होने के कारण साधारण व्यक्ति यहाँ नहीं पहुँच सकता।स्थानीय लोगों का कहना है कि आजसे लगभग 60साल पहले विष्णुदत्त उनियाल वहाँ गए थे।लौटते समय उन्होंने वहाँ एक शिवलिंग देखा।जैसे ही वह उसे उठाने के लिए हुए वह गायब हो गया।